在未来的2023年，名侦探柯南：独眼的残像讲述了一位名为维奥莱特的女性，她是一名身手敏捷、智慧超群的特工。在喧嚣的都市中，两个陌生人因为一次意外相遇，引发了一连串惊心动魄的事件。在古代文明与现代科技的碰撞中，真相渐渐浮出水面，而背后隐藏的秘密也愈发令人震惊。